Что, если самые страшные болезни и ужасающие сущности оказались бы частью нашей реальности? В сериале "13 клиническая. Начало" человечество только начинает сталкиваться с сверхъестественными явлениями, и СССР решает взять на себя инициативу, ищя врачей, готовых работать за пределами традиционной медицины. Одним из таких врачей становится Яна — психоневролог, чья жизнь и карьера рушатся после личной трагедии. Но её задача становится гораздо сложнее, когда она оказывается в центре событий, которые могут изменить все.
Прибыв в клинику, Яна сталкивается с ситуацией, которая выходит за пределы медицины: Брежнев попадает в беду после контакта с демоном, а её собственный сын оказывается в руках Люцифера. Чтобы спасти своего ребенка, Яна вынуждена стать сосудом для демона и одновременно взять на себя роль главного врача необычной больницы, которая должна лечить не только людей, но и сверхъестественные сущности.
Задача Яны и её коллег — не только осваивать новые, неизведанные методы лечения, но и исследовать мир паранормальных явлений, которые стали частью их работы. Но на фоне этого возникают вопросы, стоит ли использовать демонов и другие сущности для защиты страны от внешних угроз? Сериал развивает тему не только научного подхода, но и моральных дилемм, которые возникают, когда сверхъестественное становится частью реальной жизни.